أُنشئت كلية العلوم - الفرع الخامس بموجب المرسوم رقم 3526 تاريخ 10 تشرين الثاني 1986، واقتصرت الدراسة فيها على مواد الحلقة الأولى قبل إنشاء الحلقة الثانية بموجب المرسوم رقم 2070 تاريخ 29 أيار 2009.

تتوافر في الفرع الاختصاصات الآتية:

مرحلة الإجازة

1.    الرياضيات

2.    الرياضيات التطبيقية

3.    الفيزياء

4.    الكيمياء

5.    الكيمياء الحياتية

6.    علوم الحياة والأرض

وتتبع للفرع شعبة بنت جبيل، حيث تتوافر فيها السنة الأولى من الإجازة في الاختصاصات المذكورة أعلاه.

تعاقب على إدارة الفرع كلّ من:

الدكتور حسن كامل زين الدين: 1986 – 1988 و1992 - 2000

الدكتور خالد أديب فخر الدين: 1988 – 1992

الدكتور أكرم عقيل داغر: 2000 – 2007

الدكتورة يمامة فايز شريم: 2007 – 2012

الدكتور محمود أحمد سرور: 2012 – 2015

الدكتور وسام حبيب جمعة: 2015 – 2018

الدكتور وسيم عبد الله رمال: 2018 – 2021

الدكتور محمد اسماعيل توبي: 2021 حتى اليوم